用真诚善良美好来守护世界的三位天女和少年蓝天在经历混沌族大战后，遇到了新的危机—逃窜的混徒基拉度利用被抛弃玩偶的怨气卷土重来，大肆破坏人类世界的环境和安全，为了清除混乱元素，天女们踏上了寻找奏舞灵器的

千年一次的彗星之夜里，愿望将会实现…立志成为出色的宝可梦训练家的小智、小遥和小胜，带著皮卡丘展开了新的旅程。为了观看千年彗星出现的刹那，来到法恩斯游乐场，并认识魔术师巴特勒与黛安。在魔术表演中，小胜听到一阵细微的呼唤声…。那是在“沉眠之茧”中沉睡了千年，可帮助人类达成愿望的神奇宝贝─基拉祈。在千年彗星出现的夜晚，如果遇到拥有纯真心灵的伙伴便会苏醒。为了让基拉祈醒来，巴特勒请小胜当基拉祈的伙伴，果然，基拉祈从万花镜般的光芒中苏醒过来。虽然基拉祈只能停留短暂的7日就会再消失，但是头一次拥有属于自己的神奇宝贝的

故事设定在夜神月与L对决十年之后，世界上发生死亡笔记大量杀人事件，日本死亡笔记对策总部特别小队查出世界上共有六册死亡笔记，围绕这六册死亡笔记，全世界被卷入终极头脑战。

千年一次的彗星之夜里，愿望将会实现……

1988年7月，关东地区使用新型炸弹进行爆破，第三次世界大战即刻爆发。31年后，人类从一片废墟中重建都市，东京湾上建立了巨大城市——新东京。世界仿佛要恢复到以前的繁荣。

青春期的男生除了要用功读书，更要热衷研究「健康教育」。15岁的查拉德（永思．翁帕尼浓 饰）和欧阳（塔纳瑟．苏里雅彭查坤 饰）、欧比（基拉奇．王斯朋 饰）三个无话不谈的好基友，天天一起上下课、烦恼着撩妹