殷商末年，东海大将夜叉密谋篡权，企图暗害龙王之女以达成他统治东海的目的。不料其阴谋被陈塘关总兵李靖之子哪吒无意撞到。为了掩人耳目，夜叉将暗害龙女的罪名嫁祸给哪吒，将其变为龙族的公敌。而在另外一方，哪吒受怪仙太乙真人之命前往金光洞修道，途中遇到了遭遇夜叉暗害而失去记忆的龙女，以及精通变化和遁地之术的土行孙，三人都被太乙真人收为门徒。就在哪吒一行人潜习法术之时，夜叉却率龙宫重兵来到了陈塘关，大战一触即发。

永久、刹那、诸叶，是继承了妖怪与人类血脉的半妖少女。年幼时期被卷入森林大火而分离的双胞胎少女，永久与刹那。永久通过了能穿越时代树时空的隧道，从战国时代来到了现代。她被阿篱所在的日暮家养育长大，成长为了一名精通武道的女初中生。与此同时，留在战国时代的妹妹刹那，在已经成为除妖师首领的琥珀手下以除妖为业。诸叶是阿篱与犬夜叉的女儿，身为赏金猎人的她拥有“妖怪杀手诸叶”的绰号，每天也同样在做着除妖的工作。自从永久与刹那两人分开之后已过去10年，穿越时代树时空的隧道再度开启。永久与出现在现代的刹那重逢，但不知为何，刹