拇指总动员由拇指联盟猎手丹尼尔（Daniel小丹）、魔女萨拉（sarah小萨）和足球小子保罗（Paul小保）以及瓦莱塔的拇指居民组成。很久很久以前，在地中海上有个美丽的小岛叫瓦莱塔，他有着一个古老的传说，相传岛上埋藏着富可敌国的宝藏，而宝藏被一个神秘骑士所守护，只要找到这个骑士，通往宝藏之门变会开启。 小岛的居民为了保护小岛的安宁与外来的夺宝者展开斗争。 拇指联盟与其他拇指居民不同的是，他们拥有超能力。华丽的变身超级英雄，拥有特殊的超级技能 猎手丹尼尔（Daniel）枪管发射玻璃保护罩，用来抵挡危险和防护

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故事讲述了故障潜艇逗号，无意中遇上了来自未来的自己，得知海底地震、生物受到辐射污染、离奇失踪等事件背后藏着可怕的阴谋。逗号必须挺身而出拯救海洋危机，然而潜艇小队能完成80天环游全球的“不可能任务”吗？逗号又能否实现与潜艇小队并肩作战的梦想？